Rôzne aplikácie vyžadujú rôzne typy modifikátorov dreva; výber modifikátora by preto mal brať do úvahy zamýšľané prostredie použitia. V prípade dreva určeného na-dlhodobé vonkajšie použitie by mali byť prioritou výrobky, ktoré ponúkajú vynikajúcu odolnosť voči rozkladu, vode a poveternostným vplyvom. Naopak, pri výrobe nábytku by sa mal klásť dôraz na environmentálnu bezpečnosť a vlastnosti s nízkym-zápachom.
Je potrebné zvážiť aj konkrétne druhy dreva. Rozdiely v hustote, obsahu vlhkosti a bunkovej štruktúre medzi rôznymi typmi dreva ovplyvňujú, ako dobre modifikátor prenikne do materiálu. Vysoko-kvalitné modifikátory dreva zvyčajne ponúkajú výhody, ako je rýchle prenikanie, dobrá stabilita a jednoduchá aplikácia, čo všetko pomáha zvyšovať efektivitu výroby.
